Які недоліки RNA-seq?
Технічні обмеження у підготовці бібліотеки та високі вимоги до глибини секвенування можуть призвести до труднощі у виявленні транскриптів з низьким вмістом, потенційно недооцінка або пропуск важливих біологічних сигналів.
Як нещодавно народжений метод, він також стикається з недоліками, які, як очікується, вирішить, наприклад дуже великі вихідні файли та необхідний великий обсяг пам’яті для зберігання, величезні отримані дані потребують потужних і потужних інструментів і обладнання, таких як суперкомп’ютери, обчислювальні блоки, високошвидкісне підключення до Інтернету обробляти і…
Додатковий атом кисню в РНК робить її менш стабільною порівняно з ДНК. Реакційна здатність: з тієї ж причини, що й вище, РНК є дуже реактивною молекулою. Генетичний матеріал не повинен бути дуже реактивним і повинен залишатися стабільним.
Рідкісні клітинні популяції: scRNA-seq може виявляти рідкісні клітинні популяції, які маса РНК-seq може пропустити. Ідентифікація цих популяцій може бути складною через низька кількість клітин і низькі рівні експресії маркерних генів. Крім того, обмежена кількість клітин у рідкісних людей може призвести до технічного шуму та необ’єктивних результатів.
Обмеження всього геному Здатність ідентифікувати аномальні варіанти залежить від присутності цих варіантів послідовності в даних секвенування. Крім того, певні типи варіацій послідовності важко ідентифікувати, і їх не підтверджено для надійного виявлення для поточного клінічного використання.
